自109年5月18日起，辦理移工入住集中檢疫場所需向雇主預先收費。勞動部提醒，雇主或仲介公司於申請登錄完成後，在期限內完成繳費，逾期未繳費，該筆登錄資料不予保留；至於109年5月17日前已完成登錄申請、移工已完成或正在集中檢疫者，將另函請雇主或仲介公司於期限內完成繳費。

勞動部說明，自109年3月18日起，未持有居留證之社福類新聘僱移工入住集中檢疫所者，雇主需負擔集中檢疫14日費用計新臺幣1萬500元，持有居留證社福類及產業類之返鄉移工，雇主無需負擔費用。至於自109年4月18日起，不論有無持居留證之移工，凡入住集中檢疫所者，雇主均需負擔集中檢疫14日費用計1萬500元。

勞動部指出，集中檢疫床位申請是每日上午10時起開放4日(含當日)後7日床位申請。例：6/1可申請6/5～6/11集中檢疫床位，即D日可申請D+4～D+10日之床位；申請當日、隔日、後天及大後天之入境資料不可再於系統異動，可修改前述4日後7日中任一天當日之航班及入境移工資料，惟如需更改航班日期，則需重新登錄申請。

勞動部提醒，移工入境資料登錄完成後取得編號，需於期限內至郵局或銀行辦理臨櫃繳費，也就是雇主或仲介公司需於移工入境日(不含)前2個工作日下午3時30分完成繳費，如繳費日非工作日，則必須提前完成繳費，如：週日、週一入境，其繳費期限需提前於週四下午3時30分前完成繳費；週二入境，其繳費期限需提前於週五下午3時30分前完成繳費，若是逾期未繳費，該筆登錄資料不予保留。

勞動部說，繳費完成者，雇主或仲介公司可於繳費次日下午3時30分後查詢繳費成功與否，週五完成繳費者，可於隔週一下午3時30分後查詢繳費成功與否。期限內繳費成功者，可列印「入住集中檢疫場所證明」。若是因航班取消或其他因素，致取消入住集中檢疫場所或未住滿14日，勞動部則會依入住剩餘天數辦理退費。