疾病管制署3月8日提升菲律賓茲卡病毒旅遊疫情建議至第二級警示(Alert)，並已通知外交部等相關單位，疾管署建議孕婦及計劃懷孕婦女暫緩前往，一般旅客則應避免蚊蟲叮咬，離開流行地區後28日內性行為應使用保險套，而印尼、馬來西亞維持第一級注意(Watch)。目前國內除一名泰籍人士經確診為境外感染外，尚未傳出其他確定病例，小頭畸形新生兒人數亦未明顯異常。

  針對境外與邊境防疫，疾管署已啟動航機掃蚊、入出境衛教、入境發燒篩檢、旅客申報、港埠抽血檢驗、後送醫院診治等6大防疫措施。提醒孕婦及計劃懷孕婦女暫緩前往流行地區，如必要前往，請於離開流行地區後自主健康監測至少2周，並依醫師指示追蹤檢查。